El Club Social y Deportivo Estación Quequén se fundó el 18 de octubre de 1969 de la fusión de los clubes Juventud Unida y Progresista de Quequén y, según dicen, sus colores verde y blanco son adoptados debido a que varios de sus fundadores eran hinchas de Banfield.
En el año 1986 se consagra campeón de la Liga de Necochea y adquiere el derecho a participar del Torneo del Interior 1987/1988, arranca en la etapa provincial de dicho Torneo en la que elimina a Quilmes(Tres Arroyos), Defensa(Dolores), Los Del Clan(Madariaga) y Alumni(Azul) para así pasar a la etapa clasificatoria eliminando a Estudiantes(Olavarría), Deportivo Norte(Mar del Plata), Ferrocarril Sud(Tandil) y Argentino(Pehuajo) de esta manera llegaba al tan ansiado zonal sudeste.
En este zonal arrancaba su participación eliminando a Sol de Mayo de Viedma, Río Negro, para luego en semifinales encontrarse nada menos que con Almagro quien había perdido la final de Primera B en manos de Talleres(RE) por penales en el estadio de Huracán, el equipo de Necochea sale airoso venciendo 1 a 0 de local y perdiendo en José Ingenieros por la misma pero imponiéndose en los penales, lo que le daba el pasaporte a la final que jugaría nada menos que contra uno de los gigantes del sur Olimpo de Bahía Blanca.
La primera final se juega en el estadio de Olimpo y termina igualada 1 a 1 convirtiendo Raúl Schmidt para el aurinegro sobre el final del primer tiempo y empatando Fabian Mainardi para los de Necochea al comenzar el segundo. La segunda final sería la que daría la gloria a los albiverdes ganando 1 a 0 con gol de Luis Sánchez en el primer tiempo en el estadio de Rivadavia de Necochea.