El Consorcio de Gestión del Puerto de Quequén se constituyó a partir de la aprobación de la Ley Provincial Nº 11.414 en el mes de julio de 1993.
El mismo es definido como un ente público no Estatal que concentra los intereses del estado provincial, el municipio del Partido de Necochea, los trabajadores portuarios y los sectores privados interesados en el desarrollo portuario de la región.
Formalmente, el 1º de marzo de 1994 el Consorcio de Gestión de Puerto Quequén comenzó sus actividades en su sede de la Avenida Juan de Garay Nº 850 de la ciudad de Quequén.
Su Directorio está conformado por un Presidente (actualmente el Jorge Alvaro)-designado por el Poder Ejecutivo de la Provincia de Buenos Aires y el Gerente General José Oscar Morán – y ocho directores propuestos por los diferentes actores que intervienen en la operatoria portuaria.
Hoy integran el Directorio: Juan Carlos Peralta, Mario Goicoechea, Artemio Zufriategui, Daniel monjes, alejandro gallego, carina gonbzalez, Daniel Arce, resta el reprresnetanet de los armadores de buques.
Aunque cada sector representado en el Directorio cuenta con la posibilidad de proponer su propio candidato, los mismos están sujetos a la aprobación del Poder Ejecutivo Provincial
Así mismo, el Consorcio está conformado por diferentes áreas que componen la estructura administrativa del puerto orientada a garantizar la operatoria portuaria sobre un total de 12 sitios o muelles ubicados en ambas márgenes del río Quequén Grande donde, así mismo, funcionan las diferentes terminales que operan en el puerto en el marco de las concesiones otorgadas a diferentes empresas de capital nacional e internacional.